لزيدان العديد من المؤلفات والأبحاث العلمية في الفكر الإسلامي والتصوف وتاريخ الطب العربي كباحث ومفكر مصري متخصص في التراث العربي المخطوط وعلومه، بالإضافة الى اسهامه الأدبى المتمثل فى بعض الأعمال الروائية المنشورة كروايتى ظل الأفعى المنشورة في سلسلة روايات الهلال. قام يوسف زيدان ايضاً بكتابة مقالات دورية وغير دورية في عدد من الصحف المصرية والعربية بجانب عمله كمستشار لعدد من المنظمات الدولية الكبرى مثل: منظمة اليونسكو، منظمة الإسكوا، جامعة الدول العربية، وغيرها من المنظمات. كما شغل ايضاً منصب مدير مركز المخطوطات بمكتبة الإسكندرية لعدة سنوات ابتداءاً من عام 2001. تنوعت اعمال زيدان ما بين الكتابات الادبية و السياسية حيث قام بكتابة سلسلة مقالات فى جريدة الوطن عام 2014 بعنوان " الداعشيةُ المعاصرةُ وأصولُها" و هى رصد للأسس والقواعد العميقة، التى تقوم عليها النزعةُ الداعشيةُ.
يحرص زيدان على المشاركة فى العديد من الانشطة الثقافية و معارض الكتب الدولية وحضور الصالونات الثقافية و اقامة الندوات، غير انه اعلن اعتزاله أى فعلٍ وتفاعلٍ ثقافىٍّ فى مصر والبلاد العربية، ومقاطعة الكتابة، عبر بيان نشرة على صفحته الشخصية على موفع التواصل الإجتماعى الفيس بوك فى نوفمبر 2014 اعتراضاً على تولى الدكتور إسماعيل سراج الدين مديرا لمكتبة الإسكندرية.
العربية 
